En la década de 1940 comenzaron a formarse la mayoría de las federaciones, con el auge de las competiciones entre equipos distintas comunidades. La Federación Montañesa de Remo se fundó en 1943, el mismo año que se estableció el Campeonato del Cantábrico. Esta competición enfrentaba a los mejores equipos de Guipúzcoa, Vizcaya y Cantabria, sumando los tiempos de las regatas de San Sebastián, Bilbao y Santander.
En 1944 la Federación Española recogió el testigo de dicha competición para crear la suya propia, el Campeonato de España. En los primeros años de nuestra Federación el presidente fue D. Ángel Kaifer, que dejó su cargo en 1950, tras los problemas acaecidos en el Campeonato de España de ese año.
Desde el nombramiento de Ángel como presidente hasta el actual, Victor Canal, han ocupado dicho cargo doce personas, de la cuales solo Antonio Corino ha repetido en una ocasión. El mayor mandato de entre todos corresponde a José Antonio Martínez Liaño, que ha ocupado el cargo desde su nombramiento en 1992 hasta 2016. El resto de presidentes se citan a continuación:
1.951-1.953: D. ANGEL MADARIAGA SETIEN
1.954-1.962: D. JULIO MARTÍNEZ SÁEZ
1.963-1.965: D. JUAN JOSÉ PÉREZ DE LA TORRE
1.966-1.968: D. RAMÓN DÍEZ DE VELASCO FERNÁNDEZ
1.969-1.971: D. RAMÓN MALIAÑO PUENTE
1.972-1.975: D. ANTONIO CORINO GUEMES
1.976-1.980: D. JOSÉ LUIS PINEDO GUTIERREZ
1.981-1.984: D. ANTONIO CORINO GUEMES
1.985-1.988: D. FRANCISCO CUEVAS LORA
1.988-1.992: D. MANUEL MENOCAL LANZA
1.992-2.016: D. JOSÉ ANTONIO MARTINEZ LIAÑO
2.016-Actual: D. VÍCTOR CANAL BEDIA